Při volbě souborového systému je jedním z důležitých kritérií jeho výkonnost, tedy rychlost práce s uloženými soubory. Situace je ještě komplikovaná tím, že se čím dál častěji používají SSD, jejichž princip fungování se velmi liší od rotujících magnetických disků. Magazín Phoronix otestoval čtyři souborové systémy (ext4, Btrfs, XFS a F2FS) při práci se SSD a tři z nich (všechny kromě F2FS) s pevným diskem. Při testu bylo použito jádro 3.9.
Výsledky byly pro různé situace odlišné, nicméně v řadě testů se pozitivně projevil relativně nový systém F2FS (Flash Friendly File System), navržený přímo pro úložná zařízení typu „flash“, mezi která patří i SSD. Naopak obecně nejpomalejší, a to na obou typech disků, byl souborový systém Btrfs.