Kromě českého národního bezpečnostního týmu CSIRT.CZ existuje v rámci CZ.NIC také tým CZ.NIC-CSIRT, který se zabývá bezpečností v české národní doméně (.cz). Kromě jiného provozuje software, který umožňuje získávat z veřejných zdrojů informace o doménách, kde se vyskytuje škodlivý software (malware). Vlastníci domén jsou informováni e-mailem a tým jim je schopen poradit ohledně likvidace malwaru.
Bylo již detekováno 800 domén 2. úrovně s takovýmto obsahem, z nich už bylo přes 280 vyčištěno. V některých případech bylo „zamoření“ masivní, v případě jednoho freehostingu bylo zneužito více než 1100 domén 3. úrovně. U programu, který zajišťuje sběr dat, bude otevřen zdrojový kód, aby ho mohly (se svým individuálním nastavením) využívat i správci jiných TLD po světě.